103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5511 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5511  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.27076 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  48.78 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  40.45 
 
 
391 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  54.55 
 
 
754 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  37.97 
 
 
363 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  46.05 
 
 
362 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  46.05 
 
 
362 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  37.93 
 
 
374 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  41.77 
 
 
362 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 
363 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 
363 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  37.04 
 
 
363 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  37.97 
 
 
356 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  41.03 
 
 
363 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  41.03 
 
 
363 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  41.03 
 
 
363 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  37.78 
 
 
363 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  37.36 
 
 
363 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  39.47 
 
 
370 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  39.51 
 
 
387 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  39.51 
 
 
387 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  39.51 
 
 
387 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  38.46 
 
 
361 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  38.46 
 
 
361 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  38.46 
 
 
361 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  37.36 
 
 
363 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  37.36 
 
 
363 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  37.36 
 
 
363 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  35.8 
 
 
363 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  37.36 
 
 
363 aa  53.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  45.28 
 
 
362 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  45.28 
 
 
362 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  45.28 
 
 
362 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  45.28 
 
 
362 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  45.28 
 
 
362 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  45.28 
 
 
362 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0064  hypothetical protein  41.03 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  32.89 
 
 
365 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  45.28 
 
 
389 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  45.28 
 
 
362 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  40.98 
 
 
375 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  40.96 
 
 
1336 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  35.44 
 
 
370 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  35.44 
 
 
370 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  35.44 
 
 
367 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  35.44 
 
 
367 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  35.44 
 
 
370 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  36.36 
 
 
340 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  38.55 
 
 
343 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  38.55 
 
 
353 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  38.55 
 
 
353 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  38.55 
 
 
353 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  38.55 
 
 
353 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  38.55 
 
 
353 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  38.55 
 
 
353 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  36.36 
 
 
362 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  36.36 
 
 
362 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  36.36 
 
 
362 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  36.36 
 
 
362 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  43.4 
 
 
362 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  43.4 
 
 
362 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  39.24 
 
 
376 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  36.71 
 
 
362 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  35.44 
 
 
361 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  35.44 
 
 
361 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  35.9 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  35.9 
 
 
242 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  35.9 
 
 
333 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  30.23 
 
 
366 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  32.5 
 
 
366 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  45.45 
 
 
346 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4224  hypothetical protein  37.04 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.291894  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4638  hypothetical protein  37.04 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  37.7 
 
 
363 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  37.7 
 
 
626 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  37.04 
 
 
354 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  45.28 
 
 
351 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  45.28 
 
 
351 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  45.28 
 
 
285 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  40.51 
 
 
363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  40.51 
 
 
363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  40.51 
 
 
363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  40.51 
 
 
363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  40.51 
 
 
363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0453  remnant of ISRSO5 transposase protein  40.51 
 
 
194 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405912 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  40.51 
 
 
363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  40.51 
 
 
363 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2605  transposase, putative  43.68 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101836  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3748  putative transposase  43.64 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4503  hypothetical protein  44.44 
 
 
253 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4634  hypothetical protein  43.64 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2463  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
423 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2483  putative transposase  45.28 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244934  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  35.06 
 
 
364 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  37.65 
 
 
365 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0788  putative transposase  42.11 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  46.67 
 
 
363 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2535  transposase, putative  37.65 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4216  hypothetical protein  43.4 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0960652  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  35.53 
 
 
356 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>