32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2483 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2483  putative transposase  100 
 
 
82 aa  162  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244934  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  98.72 
 
 
351 aa  156  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  98.72 
 
 
351 aa  156  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  97.44 
 
 
285 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4503  hypothetical protein  97.44 
 
 
253 aa  154  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4634  hypothetical protein  97.44 
 
 
152 aa  153  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3748  putative transposase  98.72 
 
 
151 aa  152  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4216  hypothetical protein  94.87 
 
 
163 aa  150  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0960652  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1068  hypothetical protein  64.63 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650307  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  70.51 
 
 
351 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 
353 aa  67.8  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 
353 aa  67.8  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 
353 aa  67.8  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 
353 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 
353 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 
343 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 
353 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  46.67 
 
 
356 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5511  hypothetical protein  45.28 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.27076 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  39.13 
 
 
361 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  39.13 
 
 
361 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  39.13 
 
 
361 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  35.14 
 
 
374 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  32.86 
 
 
370 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  36.25 
 
 
362 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  36.25 
 
 
362 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  33.77 
 
 
340 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  35.94 
 
 
363 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  33.77 
 
 
362 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  33.77 
 
 
362 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  33.77 
 
 
362 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  33.77 
 
 
362 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>