53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2700 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2700  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  301  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4916  hypothetical protein  40.91 
 
 
136 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.362826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4835  hypothetical protein  40.91 
 
 
136 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4258  hypothetical protein  40.91 
 
 
136 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0779487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4147  hypothetical protein  40.91 
 
 
136 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.205919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2061  hypothetical protein  40.91 
 
 
136 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0873  hypothetical protein  40.91 
 
 
136 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000393117 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0242  transposase  38.51 
 
 
151 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000269989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2339  hypothetical protein  42.86 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2370  transposase  41.3 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00301314  normal  0.336671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2033  putative transposase  41.89 
 
 
193 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0803  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2861  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0747  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0682  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0349  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00431305  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0276  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2038  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0807  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0918  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0925  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.160138  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1060  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1065  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.73558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0239  putative transposase  41.89 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5033  putative transposase  41.89 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.0166306 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1464  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.164431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6643  putative transposase  41.89 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0393  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0457  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0464  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1309  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1379  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0494281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1426  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0473256  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1477  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1491  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.050946  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1616  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.091531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1620  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1632  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1736  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1911  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2448  transposase  34.65 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5252  integrase catalytic region  43.86 
 
 
577 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5024  integrase catalytic region  43.86 
 
 
577 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  38.89 
 
 
318 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  38.89 
 
 
318 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  38.89 
 
 
318 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3777  hypothetical protein  35.62 
 
 
265 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2959  hypothetical protein  38.36 
 
 
220 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7411  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  34 
 
 
125 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  31.52 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2605  transposase, putative  27.07 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101836  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4365  hypothetical protein  35.94 
 
 
176 aa  40  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>