282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7411 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7411  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  680    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3777  hypothetical protein  83.33 
 
 
265 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  28.66 
 
 
345 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  28.53 
 
 
345 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  29.08 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  29.08 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  33.85 
 
 
343 aa  96.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  29.86 
 
 
343 aa  96.3  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  28.98 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.08 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  29.29 
 
 
363 aa  90.1  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  29.29 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  29.29 
 
 
363 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  29.29 
 
 
363 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  29.29 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  31.14 
 
 
343 aa  87  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  32.1 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  32.1 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.26 
 
 
350 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  28.93 
 
 
363 aa  86.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  28.28 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  28.28 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  28.28 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.68 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  27.13 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  27.13 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  28.03 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  29.09 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  28.21 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  25.61 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  26.25 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  27.34 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  28.32 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  28.83 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  29.43 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  29.43 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  29.43 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  29.43 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  29.43 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  29.43 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5821  hypothetical protein  26.12 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1515  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  28.62 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  28.62 
 
 
356 aa  72.4  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  30 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  27.84 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  27.84 
 
 
626 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  28.27 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  28.27 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  28.27 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  26.98 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  26.98 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  26.98 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  26.98 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  26.98 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  24.18 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  24.92 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  24.92 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  24.92 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  24.92 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  27 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  25.26 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  25.65 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  27.92 
 
 
365 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  24.58 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  26.28 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  25.84 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  26.28 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>