45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1632 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2861  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1491  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.050946  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1616  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.091531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1620  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1632  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1736  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1911  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2038  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2448  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.603192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1477  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0276  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732422  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0349  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00431305  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0682  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0747  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0803  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0807  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0918  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0925  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.160138  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1464  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.164431  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1065  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.73558  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1060  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0393  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0457  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0464  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1309  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1379  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0494281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1426  transposase  100 
 
 
140 aa  286  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0473256  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4459  transposase  36.36 
 
 
332 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0643  transposase  36.36 
 
 
332 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1997  transposase  36.36 
 
 
332 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4534  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.36 
 
 
332 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0375  transposase and inactivated derivatives-like protein  36.36 
 
 
332 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2700  hypothetical protein  34.65 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3798  hypothetical protein  29.06 
 
 
327 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  29.73 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  28.89 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  31.51 
 
 
356 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  31.51 
 
 
356 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1265  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  43.5  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.819295  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3598  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289609  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0848  ISSod10, transposase OrfA  31.08 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  31.51 
 
 
354 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0242  transposase  26.02 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000269989  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2720  Resolvase helix-turn-helix domain protein  32 
 
 
105 aa  41.2  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0576266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05870  hypothetical protein  32.56 
 
 
171 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.786526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>