200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0953 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0953  ISRSO5-transposase protein  100 
 
 		 144 aa  298  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0694776  normal  0.301746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  69.23 
 
 		 364 aa  221  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  48.25 
 
 		 363 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  48.25 
 
 		 363 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  47.55 
 
 		 363 aa  163  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  46.85 
 
 		 583 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  47.55 
 
 		 363 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  47.55 
 
 		 363 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  46.85 
 
 		 363 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  46.85 
 
 		 363 aa  160  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  43.75 
 
 		 357 aa  137  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  43.75 
 
 		 357 aa  137  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  43.75 
 
 		 357 aa  137  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  43.75 
 
 		 357 aa  137  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  43.75 
 
 		 357 aa  137  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  46.27 
 
 		 360 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  44.96 
 
 		 363 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  44.62 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  44.96 
 
 		 363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  44.96 
 
 		 363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  44.96 
 
 		 363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  44.96 
 
 		 363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  44.96 
 
 		 363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  44.96 
 
 		 363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  44.96 
 
 		 363 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  46.51 
 
 		 365 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  41.91 
 
 		 363 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  41.91 
 
 		 363 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  41.91 
 
 		 363 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  47.29 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  41.67 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  47.29 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  47.29 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  41.01 
 
 		 363 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  39.84 
 
 		 370 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  41.54 
 
 		 626 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  41.91 
 
 		 375 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  38.3 
 
 		 362 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  41.61 
 
 		 379 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  38.3 
 
 		 362 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  38.3 
 
 		 362 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  38.3 
 
 		 362 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  42.42 
 
 		 367 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  42.75 
 
 		 367 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  46.46 
 
 		 366 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  40.77 
 
 		 374 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  41.54 
 
 		 363 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  41.18 
 
 		 363 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  36.5 
 
 		 361 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  36.5 
 
 		 361 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  36.5 
 
 		 361 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  41.67 
 
 		 370 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  37.96 
 
 		 363 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  37.96 
 
 		 363 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  40.77 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00650  isrso5-transposase protein  50 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0193031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  37.23 
 
 		 363 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  39.23 
 
 		 362 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  39.23 
 
 		 362 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  39.23 
 
 		 362 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  39.23 
 
 		 362 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  39.23 
 
 		 362 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  39.23 
 
 		 362 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  37.23 
 
 		 363 aa  110  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  37.23 
 
 		 363 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  38.64 
 
 		 361 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  38.64 
 
 		 361 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  36.5 
 
 		 363 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1944  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.181945  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  35.88 
 
 		 366 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  40.34 
 
 		 356 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  41.27 
 
 		 366 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  35.88 
 
 		 365 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  39.23 
 
 		 362 aa  104  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  39.5 
 
 		 356 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  39.5 
 
 		 356 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  39.5 
 
 		 354 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  42.52 
 
 		 346 aa  103  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  40.16 
 
 		 362 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  40.48 
 
 		 362 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  40.48 
 
 		 389 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  40.48 
 
 		 362 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  38.41 
 
 		 359 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  38.76 
 
 		 355 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  36.15 
 
 		 362 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  39.37 
 
 		 373 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>