64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0139 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  314  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  57.38 
 
 		 150 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  55.74 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  54.69 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  54.2 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  55.38 
 
 		 150 aa  153  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  47.95 
 
 		 156 aa  144  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  46.1 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  39.44 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  41.8 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  37.06 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  32.26 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  35.25 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  34.43 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  36.07 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  31.97 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  36.07 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  36.07 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  33.61 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  26.45 
 
 		 270 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  30.89 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  30.58 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  25.79 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  29.75 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  30.77 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  24.19 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  29.25 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  28.23 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  26.4 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  28.69 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  27.05 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  27.05 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  23.62 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  33.79 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  23.61 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  30 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  33.72 
 
 		 251 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  27.05 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  23.77 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  24.53 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  23.68 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  24.84 
 
 		 256 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  33.02 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  31.15 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  24.81 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  31.85 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  21.05 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  21.31 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  29.6 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  23.75 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  30.87 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  28.03 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  28.46 
 
 		 169 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  29.31 
 
 		 112 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  22.96 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  29.85 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  32.26 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  29.37 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  24.26 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  24.68 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  21.17 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>