57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0536 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  256  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  78.4 
 
 
127 aa  202  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  46.83 
 
 
116 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  40.16 
 
 
116 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  32.52 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  36 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  30.33 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1908  hypothetical protein  35.2 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.512123 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  32.79 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  40.8 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  32.23 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  34.68 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  35.48 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  33.6 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  31.5 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  30.08 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  29.23 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  35.48 
 
 
151 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  35.48 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  29.23 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  27.18 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  30.4 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  28.24 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  31.45 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  35 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  31.97 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  28.46 
 
 
174 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  33.87 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  30.33 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  27.91 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  31.15 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  27.05 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  28.12 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  27.97 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  30.23 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  34.92 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  29.55 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  26.83 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  26.77 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  34.15 
 
 
115 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  28.03 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  41.38 
 
 
169 aa  47.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  27.2 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  27.13 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  28.46 
 
 
270 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  23.62 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  29.46 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2749  hypothetical protein  29.51 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.172817  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0509  hypothetical protein  27.78 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0289752  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2369  hypothetical protein  29.51 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.380561  hitchhiker  0.0000591661 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  35.71 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  27.91 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0156  hypothetical protein  22.83 
 
 
143 aa  40.8  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  24.26 
 
 
151 aa  40.8  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  25.58 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>