50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3773 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  51.35 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  53.45 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  56.64 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  55.75 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  55.75 
 
 		 113 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  53.91 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  54.78 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  53.91 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  60 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  42.14 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  39.72 
 
 		 145 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  40.69 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  36.84 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  34.67 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  39.02 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  35.86 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  32.76 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  32.7 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  34.04 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  38.52 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  30.28 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  35.65 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  29.91 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  31.78 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  31.3 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  32 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  25.32 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  26.76 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  34.95 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  29.91 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  30.97 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  26.89 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  37.86 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  28.71 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  29.82 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  27.2 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  30.6 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  24.58 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  27.97 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  29.63 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  30.43 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  29.31 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  31.97 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0896  hypothetical protein  24.39 
 
 		 163 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  29.91 
 
 		 150 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2490  hypothetical protein  28.1 
 
 		 161 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>