56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2301 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  100 
 
 		 162 aa  331  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  53.85 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  40 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  40.56 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  41.43 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  46.67 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  40.54 
 
 		 153 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  44.07 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  35.04 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  34.53 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  33.93 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  33.86 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  35.9 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  41.18 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  36.18 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  31.9 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  33.6 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  29.91 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  37.7 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  31.09 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  29.27 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  31.03 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  27.73 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  32 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  29.23 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  27.82 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  26.87 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  34.91 
 
 		 113 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  29.91 
 
 		 116 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  37.4 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  33.96 
 
 		 113 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  29.57 
 
 		 114 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  38.52 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  33.02 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  28.21 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  36.67 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  35 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  29.75 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  35.54 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  26.23 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  35.07 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  31.93 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  24 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  27.5 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  25.64 
 
 		 112 aa  44.7  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  25.69 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  30.48 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  28.69 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  28.99 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  30.53 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  33.63 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  27.91 
 
 		 123 aa  41.6  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  25.55 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  29.27 
 
 		 115 aa  41.2  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>