38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1669 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  97.35 
 
 		 113 aa  227  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  96.46 
 
 		 113 aa  226  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  55.75 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  55.75 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  53.98 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  53.98 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  53.98 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  54.87 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  43.75 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  49.56 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  34.45 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  32 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  31.97 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  33 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  35 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  29.29 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  32.77 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  36.67 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  35.14 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  38.33 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  32.17 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  34.91 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  32.79 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  32.67 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  35.58 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  31.03 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  38.1 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  30.39 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  31.62 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  28.45 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  35.71 
 
 		 144 aa  42  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  29.29 
 
 		 110 aa  40  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  29.17 
 
 		 171 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>