64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0692 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  100 
 
 
147 aa  303  6e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  74.83 
 
 
146 aa  231  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  56.08 
 
 
147 aa  168  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  48.63 
 
 
150 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  44.59 
 
 
163 aa  137  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  40 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  42.86 
 
 
153 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  43.65 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  33.09 
 
 
150 aa  87.4  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  33.83 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  38.52 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  35.86 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  29.63 
 
 
168 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  33.1 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  32.91 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  30 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  34.68 
 
 
152 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  32.28 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  35.29 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  29.06 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  29.66 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  31.54 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  35.29 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  34.35 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  29.77 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  31.29 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  31.03 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  27.11 
 
 
162 aa  54.3  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  33.88 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  27.34 
 
 
127 aa  53.9  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  33.06 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  32.77 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  31 
 
 
144 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  29.6 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  27.27 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  29.01 
 
 
176 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  26.62 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  29.41 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  29.63 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  28.12 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  30.6 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  27.15 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  28.46 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  25.83 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  27.13 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  27.2 
 
 
174 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  22.54 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  28.46 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  24.79 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2490  hypothetical protein  28.39 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  23.28 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  32.94 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  25.41 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  25.18 
 
 
145 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  24.62 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  26.4 
 
 
150 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  26.77 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  24.79 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  28.57 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  25 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  25.83 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  26.98 
 
 
246 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  26.45 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>