48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1233 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  243  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  44.88 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  46.83 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  33.62 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  29.91 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1908  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.512123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  33.04 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  36.28 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  33.67 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  34.21 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  28.32 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  30.09 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  26.72 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  30.25 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  27.73 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  30 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  27.43 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1945  hypothetical protein  31.82 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000150521  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  27.93 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  38.6 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  26.5 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  28.7 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  30 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  26.96 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  28.16 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  26.09 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  23.68 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  26.96 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  29.75 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  29.75 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  24.14 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  28.45 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  25.62 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  29.31 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  30 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  28.45 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2369  hypothetical protein  29.73 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.380561  hitchhiker  0.0000591661 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2749  hypothetical protein  29.73 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.172817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  27.59 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  32.14 
 
 		 144 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  24.79 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  27.88 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  21.71 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  26.15 
 
 		 246 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  25 
 
 		 150 aa  40  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>