63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1583 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  243  6e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  31.82 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  36.61 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  27.68 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  29.46 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  30.19 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  34.96 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  24.77 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  26.61 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  34.17 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  29.73 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  30.09 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  33.7 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  26.55 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  28.32 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  34.43 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  34.43 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1016  hypothetical protein  28.18 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.041668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  26.92 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  33.91 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  27.18 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  30.61 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  31.25 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  31.9 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  30.3 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  28.04 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  29.29 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  24.07 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  27.87 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  23.62 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  24.55 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  28.04 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  27.19 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  30.97 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  26.72 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  26.96 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  28.16 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  25.62 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  26.72 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  30 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  26.23 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  31.17 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  28.87 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  23.14 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  27.27 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  25.58 
 
 		 246 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  27.78 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  24.11 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  25.21 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  25.83 
 
 		 256 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  27.5 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  24.39 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  27.08 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  27.34 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  20 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  28.07 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  21 
 
 		 180 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  25 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  26.72 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  25.86 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>