59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0805 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  309  6.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  38.78 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  34.76 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  37.4 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  38.98 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  42.57 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  33.09 
 
 
147 aa  87.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  35.04 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  42.57 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  32.34 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  29.66 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  34.96 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  39.5 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  35.9 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  34.04 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  31.21 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  30.72 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  31.58 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  29.56 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  32.5 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  29.11 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  33.88 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  26.67 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  34.45 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  34.51 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  28.12 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  26.61 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  24.03 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  31.67 
 
 
152 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  33.7 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  25.93 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  28.23 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  30 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  30.43 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  26.72 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  28.57 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  35.58 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  31.21 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  31.67 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  31.67 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  28.79 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  34.62 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  27.12 
 
 
180 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  28.41 
 
 
246 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  33.65 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  26.32 
 
 
152 aa  47  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  27.87 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  31.3 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  34.04 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  27.87 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  29.91 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  28.72 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  28.45 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  24.03 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  27.59 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  25.22 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  27.05 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>