25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1146 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  335  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  50.4 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  29.01 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  28.8 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  32 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  30.95 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  27.64 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  29.11 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  29.03 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  26.71 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  28.24 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  26.45 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  27.05 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  26.35 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  25 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  29.17 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  26.02 
 
 		 246 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  24.41 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  21.19 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  25.2 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  29.37 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0509  hypothetical protein  27.27 
 
 		 165 aa  42  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0289752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  30.16 
 
 		 145 aa  42  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  44.44 
 
 		 417 aa  41.6  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  26.72 
 
 		 112 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>