33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2583 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  57.85 
 
 
159 aa  142  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  47.44 
 
 
158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  48.78 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  43.14 
 
 
152 aa  128  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  48.76 
 
 
153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  44.92 
 
 
181 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  41.18 
 
 
162 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  36.67 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  36.49 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  38.06 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  37.5 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  35.1 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  37.07 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  35.51 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  36.07 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  32.23 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  34.96 
 
 
150 aa  67  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  33.62 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  30.95 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  27.88 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  30.5 
 
 
169 aa  57  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  29.73 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  26.67 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  31.37 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  28.76 
 
 
147 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  32.48 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  25.61 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  25 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  27.56 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  30.33 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>