47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4871 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  316  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  58.55 
 
 
151 aa  187  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  33.91 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  26.55 
 
 
119 aa  59.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  27.87 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  31.25 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  29.91 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  34.45 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  28.91 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  28.95 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  25.33 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  33.01 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  32.99 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  24.63 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  27.27 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  31.33 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  30.67 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  29.2 
 
 
110 aa  50.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  26.77 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  24.32 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  26.15 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  29.82 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  29.29 
 
 
169 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  29.87 
 
 
110 aa  47  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  25.22 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  28.91 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  25.33 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  28.91 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  34.4 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  32.73 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  29.66 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  27.73 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0156  hypothetical protein  31.96 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  29.71 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1016  hypothetical protein  28.83 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.041668  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  26.53 
 
 
174 aa  42.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  24.24 
 
 
246 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  29.93 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  29.11 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  25.86 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  21.9 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  29.51 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  25.66 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  31.52 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  28.57 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>