18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1760 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  100 
 
 		 166 aa  341  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2490  hypothetical protein  44.23 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  27.86 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  28.89 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  29.77 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0509  hypothetical protein  31.09 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0289752  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  24.22 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  28.35 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  27.87 
 
 		 119 aa  51.6  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  25.51 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1476  hypothetical protein  29.69 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.332272  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  26.15 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0837  hypothetical protein  30.3 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0344498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  29.91 
 
 		 176 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  25 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>