44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6946 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  100 
 
 
151 aa  315  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  58.55 
 
 
151 aa  187  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  33.04 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  29.66 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  27.68 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  33.94 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  31.25 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  30.17 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  28.21 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  29.57 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  29 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  33.6 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  28.21 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  30.97 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  29.22 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  26.4 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  30.71 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  26.92 
 
 
150 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  27.97 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  28.74 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  27.45 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  27.27 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  29.82 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  28.46 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  30.3 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  25.38 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  33.33 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  26.09 
 
 
180 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  25.66 
 
 
111 aa  47  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  25.66 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  27.67 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  27.35 
 
 
242 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  30.43 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  26.61 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  23.21 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  25.21 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  28.03 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  23.48 
 
 
174 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1366  putative secreted protein  32.94 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1016  hypothetical protein  25.69 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.041668  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  25.83 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0509  hypothetical protein  26.56 
 
 
165 aa  40.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0289752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  27.52 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  24.58 
 
 
155 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>