55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2158 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  331  3e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  49.07 
 
 		 146 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  43.48 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  44.59 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  39.63 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  40.56 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  42.28 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  38.89 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  34.76 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  36.54 
 
 		 140 aa  84  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  38.64 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  38.04 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  38.04 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  31.47 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  33.73 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  31.62 
 
 		 137 aa  67  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  30.47 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  32.7 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  30.23 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  25.3 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  29.46 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  27.54 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  28.24 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  30.37 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  29.41 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  26.97 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  27.22 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  24.82 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  29.71 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  24.54 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  25.38 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  27.91 
 
 		 123 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  25.6 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  26.92 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  26.24 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  27.41 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  29.01 
 
 		 116 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  31.33 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  28.74 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  27.61 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  27.15 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  26.95 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  23.53 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  25.81 
 
 		 246 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  24.64 
 
 		 168 aa  47.4  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  27.82 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  21.43 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  25.58 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  27.34 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  25.74 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  25.38 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  24.48 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  25.76 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  28.95 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  21.71 
 
 		 116 aa  40.8  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>