50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4380 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  308  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  81.33 
 
 		 150 aa  246  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  78 
 
 		 150 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  66.67 
 
 		 151 aa  212  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  54.69 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  53.91 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  53.66 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  52.76 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  42.74 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  31.71 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  28.15 
 
 		 270 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  31.97 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  30.33 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  29.51 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  34.33 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  35.25 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  30.08 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  28.69 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  32.8 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  35.77 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  29.86 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  28.93 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  28.46 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  25.33 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  31.29 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  27.33 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  26.71 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  24.54 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  22.31 
 
 		 242 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  25 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  31.62 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  25 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  28.22 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  27.19 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  25.38 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  27.92 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  24.05 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  23.9 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  25.41 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  24.19 
 
 		 251 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  25.34 
 
 		 256 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  27.87 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  26.67 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  21.02 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  29.46 
 
 		 112 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  19.83 
 
 		 116 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>