13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1016 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1016  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  220  4.9999999999999996e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.041668  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  28.18 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  30.77 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  32.08 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  32 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  27.93 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  33.02 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  29.63 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  30.19 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  28.43 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  28.83 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  29.46 
 
 
112 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  25.69 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>