28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1835 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  478  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  35.8 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  27.39 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  31.94 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  32.38 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2155  hypothetical protein  27.12 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  27.97 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  30.77 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  22.66 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  22.31 
 
 		 150 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  27.12 
 
 		 154 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  23.97 
 
 		 150 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  24.67 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  22.6 
 
 		 151 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  24.17 
 
 		 116 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  27.97 
 
 		 111 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  23.28 
 
 		 115 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  26.67 
 
 		 144 aa  46.6  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  35.04 
 
 		 112 aa  45.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  27.35 
 
 		 151 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  18.11 
 
 		 150 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  29.66 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  27.38 
 
 		 116 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  20 
 
 		 119 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  25.6 
 
 		 162 aa  42.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2819  urocanate hydratase  32.17 
 
 		 549 aa  42  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2333  urocanate hydratase  34.18 
 
 		 550 aa  41.6  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345602  normal  0.755078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>