16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0461 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  33.47 
 
 
242 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  29.32 
 
 
246 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  26.94 
 
 
256 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2155  hypothetical protein  26.45 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  26.46 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  30.33 
 
 
144 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  27.07 
 
 
150 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  27.44 
 
 
156 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  33.72 
 
 
151 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  24.09 
 
 
144 aa  46.2  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  24.19 
 
 
150 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  22.58 
 
 
150 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  25.93 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  23.39 
 
 
150 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  26.27 
 
 
153 aa  42  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>