45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3669 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  314  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  76.92 
 
 		 156 aa  251  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  52.32 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  56.92 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  51.68 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  55.38 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  55.38 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  46.67 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  39.73 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  34.43 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  34.96 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  32.52 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  26.67 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  29.84 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  28.46 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  30.95 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  29.85 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  30.89 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  31.45 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  29.27 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  28.86 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  26.4 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  27.01 
 
 		 251 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  23.97 
 
 		 242 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  29.11 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  29.29 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  26.02 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  25.41 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  25.41 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  22.52 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  26.75 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  24.39 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  22.48 
 
 		 270 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  24 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  23.14 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  25.17 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  29.27 
 
 		 256 aa  43.5  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  23.68 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  26.32 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  23.53 
 
 		 168 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  38 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  21.95 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>