28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3049 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  295  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  51.16 
 
 
155 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  47.11 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  39.04 
 
 
159 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  38.21 
 
 
158 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  38.14 
 
 
162 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  36.67 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  41.67 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  35.59 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  30.33 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  33.04 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  27.1 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  31.97 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  28.24 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  29.51 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  27.33 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  30.33 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  27.15 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  35.78 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  28.16 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  24.65 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  28.47 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  30.21 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  30.21 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  30.16 
 
 
160 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  25.18 
 
 
147 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  31.76 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>