20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0171 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  535  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  27.39 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  27.56 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  27.52 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  26.23 
 
 		 251 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2155  hypothetical protein  21.09 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  29.41 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  26.4 
 
 		 144 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  25.34 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  27.35 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.77 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  25.83 
 
 		 119 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  22.14 
 
 		 150 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  22.61 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  28.05 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  27.83 
 
 		 116 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  29.27 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  29.06 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  23.2 
 
 		 150 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>