28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3678 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  290  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  38.1 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  38.28 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  39.42 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  40.98 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  35.94 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  34.75 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  36 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  40.94 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  35.83 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  41.67 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  35.83 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  36.13 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  28.35 
 
 		 270 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  33.59 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  28.35 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  27.43 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  31.67 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  27.64 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  32.77 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  30.33 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  28.46 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  27.87 
 
 		 246 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  26.4 
 
 		 256 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  25.69 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  28 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>