40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0056 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  318  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  47.47 
 
 
159 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  54.62 
 
 
150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  46.72 
 
 
181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  46.67 
 
 
155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  41.67 
 
 
162 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  41.77 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  46.34 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  38.21 
 
 
145 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  36.52 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  34.43 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  31.97 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  32.52 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  35.65 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  30.08 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  28.69 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  28 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  31.67 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  30.23 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  29.03 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  31.03 
 
 
146 aa  54.3  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  26.45 
 
 
160 aa  51.2  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  29.63 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  30.33 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  26.95 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  29.41 
 
 
115 aa  48.9  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  28.79 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  28.16 
 
 
116 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  27.16 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  35.35 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  25.21 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  32.99 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  29.75 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  32.99 
 
 
154 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  30.7 
 
 
112 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  33.63 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  32.38 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  27.35 
 
 
115 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  28.33 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>