53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3025 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  336  8e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  43.22 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  41.67 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  41.18 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  41.18 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  42.62 
 
 		 151 aa  94.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  42.74 
 
 		 150 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  43.44 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  38.14 
 
 		 145 aa  91.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  41.8 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  34.71 
 
 		 152 aa  90.5  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  34.75 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  42.74 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  37.17 
 
 		 181 aa  84.3  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  38.33 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  36.07 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  34.43 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  31.9 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  31.03 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  31.93 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  29.75 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  29.85 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  30.89 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  30.89 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  31.97 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  27.11 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  26.72 
 
 		 115 aa  53.9  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  29.06 
 
 		 115 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  26.87 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  29.32 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  33.61 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  35.48 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  26.67 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  23.53 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  26.96 
 
 		 119 aa  48.5  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  26.35 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  26.4 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  32.26 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  32.5 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  26.67 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  28.97 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  23.62 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  24.14 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  28.28 
 
 		 112 aa  45.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  23.58 
 
 		 270 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  31.97 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  28.85 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  26.05 
 
 		 242 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  29.17 
 
 		 115 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  23.68 
 
 		 112 aa  40.8  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>