67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2357 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  234  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  57.39 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  46.09 
 
 		 115 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  46.09 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  50.44 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  47.79 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  44.95 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  34.78 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  37.86 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  35.48 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  32.26 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  38.24 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  39.22 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  27.43 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  31.86 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  41.38 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  29.17 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  31.9 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  36.27 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  36.27 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  36.27 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  33.33 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  35.45 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  31.71 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  33.64 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  36.11 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  25 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  34.95 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  33.33 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  34.95 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  34.95 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  40 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  33.08 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  31.4 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  30.7 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  31.82 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  28.95 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  27.78 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  33.94 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  29.2 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  25.81 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  30.65 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1908  hypothetical protein  31.52 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.512123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  32.26 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  30.61 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  36.21 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  31.2 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  29.73 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  31.68 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  30.36 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2749  hypothetical protein  34.23 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.172817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  32.5 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  30.65 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2369  hypothetical protein  34.23 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.380561  hitchhiker  0.0000591661 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  26.98 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  25.36 
 
 		 154 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1016  hypothetical protein  29.2 
 
 		 113 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.041668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  28.81 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  37.5 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  30.23 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  24.81 
 
 		 177 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>