19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2369 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2749  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  223  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.172817  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2369  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  223  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.380561  hitchhiker  0.0000591661 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  33.93 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  30.09 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  33.03 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  29.51 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1908  hypothetical protein  28.8 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.512123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  29.73 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  30.08 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  31.9 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  25.71 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  28.33 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  29.66 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  26.32 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  27.93 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  33.91 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  27.97 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  28.7 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>