76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2602 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  235  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  45.22 
 
 
114 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  57.39 
 
 
115 aa  105  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  46.96 
 
 
115 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  42.48 
 
 
111 aa  92  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  46.02 
 
 
112 aa  92  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  39.82 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  38.26 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  38.71 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  37.4 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  34.19 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  35.34 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  33.33 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  43 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  40.38 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  36 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  43 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  35 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  33.04 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  35.9 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  38.38 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  31.93 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  34.75 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  30.89 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  35.29 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  30.47 
 
 
163 aa  62.8  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  35.29 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  36.28 
 
 
116 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  37.5 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  27.87 
 
 
151 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  32.43 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  30.09 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  29.57 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  34.19 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  26.15 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  29.91 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  31.09 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  28.46 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  26.4 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  28.95 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  26.13 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  40 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1908  hypothetical protein  33.87 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.512123 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  30.17 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  26.83 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  27.87 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  26.02 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  30.3 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  29.46 
 
 
177 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  30.19 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  23.21 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  29.55 
 
 
176 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  32.35 
 
 
113 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  27.35 
 
 
174 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  26.72 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  30 
 
 
176 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  23.28 
 
 
242 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  28.57 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3001  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.51412  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  26.23 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  27.35 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0509  hypothetical protein  28.44 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0289752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  28.46 
 
 
169 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  33.04 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  26.05 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  27.36 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  27.73 
 
 
246 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2490  hypothetical protein  31.93 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0227  hypothetical protein  27.87 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.720265  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  24.81 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  28.33 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>