21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0504 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  310  6.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  45.45 
 
 
154 aa  143  8.000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  29.2 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  26.97 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  22.15 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  28 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  26.81 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  26.36 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  27.59 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  25.51 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  29.31 
 
 
169 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  24.84 
 
 
153 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  28.83 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  26.88 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1860  hypothetical protein  24.67 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00347774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3001  hypothetical protein  29.47 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.51412  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2490  hypothetical protein  25 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  23.58 
 
 
111 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  36.96 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  30.61 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>