44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1053 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  30.37 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0509  hypothetical protein  31.62 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0289752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  31.97 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  34.96 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2490  hypothetical protein  29.45 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  32.79 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  27.13 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  31.03 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  31.86 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  30.97 
 
 		 111 aa  57.4  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  36.76 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0837  hypothetical protein  35.9 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0344498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  30.25 
 
 		 116 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  30.17 
 
 		 115 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  31.68 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  30 
 
 		 112 aa  51.6  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  31.29 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  31.52 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  38.6 
 
 		 112 aa  51.6  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  26.32 
 
 		 115 aa  50.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  28.71 
 
 		 110 aa  48.5  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  26.05 
 
 		 115 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  30.17 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  27.12 
 
 		 150 aa  48.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  26.09 
 
 		 151 aa  47.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  26.36 
 
 		 151 aa  47.8  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  29.82 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  25.66 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  26.4 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  25.86 
 
 		 112 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  26.88 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0661  hypothetical protein  29.06 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.700747  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1996  hypothetical protein  29.47 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  30.77 
 
 		 152 aa  44.7  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  30.16 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  29.37 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  34.55 
 
 		 116 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  28.45 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1310  hypothetical protein  25.66 
 
 		 183 aa  42  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1908  hypothetical protein  40.35 
 
 		 124 aa  42  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.512123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  21 
 
 		 119 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>