58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0267 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  296  7e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  30.46 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  32.21 
 
 
159 aa  62  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  30.91 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  30.37 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  27.91 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  29.75 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  28.89 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  30.89 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  29.03 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  26.13 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  28.46 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  29.01 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2583  hypothetical protein  29.91 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  28.81 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  28.81 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  28.57 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  32.32 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  29.79 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  31 
 
 
147 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  35.37 
 
 
152 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  31.19 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  28.07 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  28.21 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  29.07 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  29.63 
 
 
181 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  24.5 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  25.18 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  26 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  29.41 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  26.27 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  26.83 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  26.67 
 
 
242 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  27.68 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  28.21 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  24.09 
 
 
251 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  25 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  35.35 
 
 
158 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  21.43 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  22.61 
 
 
256 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  29.7 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  24.6 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  24.16 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  21.19 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  25.89 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  23.84 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  27.39 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  35.71 
 
 
113 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  35.71 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  32.14 
 
 
116 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  26 
 
 
150 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  35.71 
 
 
127 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  25 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  22.52 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  27.5 
 
 
169 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  35 
 
 
154 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>