28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0563 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  44.11 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  35.8 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  27.56 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  29.03 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  32.26 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  31.71 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  29.27 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  28.33 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  26.54 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2155  hypothetical protein  22.22 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  29.91 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  31.33 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3678  hypothetical protein  27.87 
 
 		 144 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  28.57 
 
 		 162 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  28.41 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  25.21 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  25.81 
 
 		 163 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  29.41 
 
 		 111 aa  46.2  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  26.44 
 
 		 116 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  25.58 
 
 		 119 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  25.95 
 
 		 168 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  28.57 
 
 		 111 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1146  hypothetical protein  26.02 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.545594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  24.24 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  27.73 
 
 		 115 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>