14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2155 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2155  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  485  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  27.66 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0171  hypothetical protein  21.92 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.471424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0461  hypothetical protein  26.45 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2302  Domain of unknown function DUF1791  21.72 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162762  normal  0.0557387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  22.18 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  32.58 
 
 		 275 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.58 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2965  hypothetical protein  30.77 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.886071  normal  0.911505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  23.53 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  27.12 
 
 		 111 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  28.57 
 
 		 286 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0156  hypothetical protein  34 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  27.55 
 
 		 277 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>