24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0874 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  350  4e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0406  hypothetical protein  29.1 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.612402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3254  hypothetical protein  28.77 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1265  hypothetical protein  29.66 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0931  hypothetical protein  26.92 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3111  hypothetical protein  28.17 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2392  hypothetical protein  30.53 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3101  hypothetical protein  28.17 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1599  hypothetical protein  27.74 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 397 aa  52  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  27.59 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2818  hypothetical protein  27.61 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2998  hypothetical protein  27.61 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.695774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2901  hypothetical protein  26.87 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  26.28 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  29.17 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  30.38 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0818  domain of unknown function DUF1791  21.6 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.720917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  24.26 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  31.58 
 
 		 115 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  33.93 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  31.52 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  32.76 
 
 		 112 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  29.63 
 
 		 112 aa  40.8  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>