More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1073 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1073  fhu operon transcription regulator  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000339087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  26.73 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 319 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  24.01 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0152  transcriptional regulator, LysR family  24.19 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  24 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  23.48 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  22.98 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2421  LysR substrate-binding  26.96 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  23.95 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  23.95 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  25.51 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  23.62 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  23.62 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  23.62 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  23.62 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  26 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4541  transcriptional regulator, LysR family  23.9 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  0.532762 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3469  transcriptional regulator, LysR family  23.9 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0811329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  23.95 
 
 		 311 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  22 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  24 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0242  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  25.98 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7124  transcriptional regulator, LysR family  21.8 
 
 		 288 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2575  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 318 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210172 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0677  putative transcriptional activator METR transcription regulator protein  23.11 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0439978  normal  0.107972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2962  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478402  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0252  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.682198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3293  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  21.78 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5705  DNA-binding transcriptional regulator CynR  23.9 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.202456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  26.7 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4594  LysR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  19.14 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5949  DNA-binding transcriptional regulator CynR  23.9 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233312  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  20.08 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  26.17 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  23.69 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0570  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6393  LysR family transcriptional regulator  19.66 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2116  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0265238 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4876  LysR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0982311 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  19.73 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  19.73 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  22.38 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  19.73 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  19.73 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5884  LysR family transcriptional regulator  19.38 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  19.73 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  23 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  19.73 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  19.73 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5520  LysR family transcriptional regulator  19.38 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  20.64 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  22.4 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  21.25 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4076  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  20.64 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  25.71 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  22.93 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5738  LysR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0329452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4934  LysR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4460  LysR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4819  LysR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4567  LysR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0355  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4154  transcriptional regulator, LysR family  25.69 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3801  LysR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3996  LysR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>