More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0111 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0111  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  100 
 
 
250 aa  503  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  48.15 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  47.76 
 
 
265 aa  242  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  48.15 
 
 
253 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 
245 aa  239  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  46.86 
 
 
245 aa  239  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  47.54 
 
 
253 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.18 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 
244 aa  233  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  47.13 
 
 
253 aa  231  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0670  ABC transporter related  46.47 
 
 
246 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  49.17 
 
 
244 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  48.96 
 
 
244 aa  228  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  47.86 
 
 
253 aa  228  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.72 
 
 
252 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 
244 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.56 
 
 
247 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 
244 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 
244 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.72 
 
 
252 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.72 
 
 
252 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 
244 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  47.33 
 
 
240 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.77 
 
 
244 aa  226  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  48.16 
 
 
250 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 
244 aa  225  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 
244 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 
244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.54 
 
 
252 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  48.15 
 
 
251 aa  224  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  48.39 
 
 
243 aa  224  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.94 
 
 
242 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  44.86 
 
 
240 aa  224  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  45.68 
 
 
240 aa  224  9e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.35 
 
 
244 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.37 
 
 
249 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.94 
 
 
250 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 
240 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.56 
 
 
247 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.76 
 
 
250 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
242 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.76 
 
 
250 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.76 
 
 
250 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  47.76 
 
 
250 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.53 
 
 
250 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.94 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  46.94 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0292  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.94 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.94 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.94 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  46 
 
 
255 aa  221  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.4 
 
 
253 aa  221  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.4 
 
 
253 aa  221  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 
244 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  45.9 
 
 
243 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 
244 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 
244 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  45.71 
 
 
242 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  45.9 
 
 
243 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  46.91 
 
 
240 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.94 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  45.87 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  44.9 
 
 
244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.53 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  46.61 
 
 
256 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0779  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.91 
 
 
240 aa  218  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0174  ABC transporter related  48.29 
 
 
253 aa  218  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0313265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  45.24 
 
 
254 aa  218  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  47.01 
 
 
263 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  45.34 
 
 
243 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1456  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
261 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  46 
 
 
274 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  46.5 
 
 
248 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46 
 
 
253 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1011  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  46.75 
 
 
250 aa  217  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.648524  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0374  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  43.37 
 
 
257 aa  216  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.293894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  45.34 
 
 
243 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  45.34 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  43.58 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 
240 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  44.18 
 
 
244 aa  215  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  46.31 
 
 
244 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3380  ABC transporter related  46.61 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679139  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  45.34 
 
 
242 aa  214  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  45.34 
 
 
242 aa  214  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  45.6 
 
 
274 aa  214  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 
243 aa  214  8e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03640  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 
245 aa  214  8e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
240 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  46.31 
 
 
240 aa  214  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
240 aa  214  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
240 aa  214  9e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  46.31 
 
 
240 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
240 aa  214  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
240 aa  214  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
240 aa  214  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
240 aa  214  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>