More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19630 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
365 aa  725    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.43 
 
 
349 aa  455  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.26 
 
 
366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  67.23 
 
 
351 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.14 
 
 
351 aa  448  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  65.17 
 
 
365 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.53 
 
 
341 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.97 
 
 
349 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64 
 
 
342 aa  431  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.14 
 
 
355 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.47 
 
 
353 aa  425  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.56 
 
 
344 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.97 
 
 
344 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.97 
 
 
344 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.66 
 
 
347 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.35 
 
 
345 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.97 
 
 
344 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0695  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.69 
 
 
353 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.97 
 
 
356 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.43 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.71 
 
 
341 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.87 
 
 
341 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.08 
 
 
355 aa  372  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.73 
 
 
349 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0112  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.65 
 
 
341 aa  345  8e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.241314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.76 
 
 
347 aa  319  6e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.41 
 
 
351 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50.14 
 
 
352 aa  308  8e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9024  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.03 
 
 
353 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.45 
 
 
353 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6574  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
353 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.3 
 
 
341 aa  296  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.09 
 
 
336 aa  295  6e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.09 
 
 
339 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.27 
 
 
342 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0462  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
357 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
332 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.81 
 
 
339 aa  289  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.58 
 
 
340 aa  288  7e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0218  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.75 
 
 
355 aa  288  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.61 
 
 
328 aa  286  4e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3527  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.03 
 
 
355 aa  285  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0494  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.53 
 
 
352 aa  285  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.85 
 
 
337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9310  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.9 
 
 
355 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853778  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.45 
 
 
335 aa  281  9e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.08 
 
 
349 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.43 
 
 
340 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.65 
 
 
349 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0261  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
359 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.73 
 
 
340 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.98 
 
 
339 aa  275  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.82 
 
 
350 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.88543 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.01 
 
 
340 aa  275  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.77 
 
 
338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.94 
 
 
338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.6 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.77 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.94 
 
 
348 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.5 
 
 
342 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.01 
 
 
348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.75 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.44 
 
 
348 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.96 
 
 
348 aa  272  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.32 
 
 
338 aa  272  7e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.93 
 
 
340 aa  271  9e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1073  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.22 
 
 
337 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
339 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
339 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.56 
 
 
344 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3170  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.66 
 
 
348 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
339 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
332 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0227  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.56 
 
 
353 aa  269  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.56 
 
 
344 aa  269  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.56 
 
 
351 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0266  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
353 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.53 
 
 
339 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.45 
 
 
340 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.45 
 
 
340 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.2 
 
 
344 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.68 
 
 
340 aa  266  5e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.2 
 
 
344 aa  266  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.5 
 
 
337 aa  266  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.3 
 
 
333 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.09 
 
 
347 aa  266  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.82 
 
 
341 aa  265  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  43.89 
 
 
340 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002872  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.38 
 
 
337 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797453  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1717  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.08 
 
 
347 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.806069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1340  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.52 
 
 
341 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.665671 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0800  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  43.25 
 
 
340 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000180575  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.26 
 
 
338 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.06 
 
 
329 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.65 
 
 
344 aa  263  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.92 
 
 
345 aa  262  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.34 
 
 
340 aa  262  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.69 
 
 
340 aa  262  6.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>