More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3981 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
341 aa  674    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  86.76 
 
 
342 aa  586  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  83.38 
 
 
347 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  82.89 
 
 
344 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  82.89 
 
 
344 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  82.89 
 
 
344 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  82.89 
 
 
344 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  80.35 
 
 
345 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.71 
 
 
356 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0695  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.36 
 
 
353 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.04 
 
 
349 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.15 
 
 
355 aa  491  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.11 
 
 
353 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.76 
 
 
351 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  72.35 
 
 
351 aa  475  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.35 
 
 
349 aa  477  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.76 
 
 
341 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.55 
 
 
366 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.16 
 
 
341 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  63.53 
 
 
365 aa  435  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.57 
 
 
341 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  64.41 
 
 
365 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.99 
 
 
349 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.71 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0112  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.88 
 
 
341 aa  351  1e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.241314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.52 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.42 
 
 
341 aa  293  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.28 
 
 
342 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
340 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.27 
 
 
342 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
336 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48 
 
 
341 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.55 
 
 
344 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.58 
 
 
339 aa  285  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.81 
 
 
339 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.81 
 
 
339 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.84 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0034  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.69 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.13 
 
 
339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
344 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.51 
 
 
345 aa  282  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.28 
 
 
344 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.13 
 
 
351 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
344 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
357 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
344 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50.29 
 
 
339 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.7 
 
 
344 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2775  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.69 
 
 
340 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.64 
 
 
340 aa  279  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.64 
 
 
340 aa  279  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0044  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.4 
 
 
340 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
339 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.81 
 
 
341 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
335 aa  280  4e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.13 
 
 
344 aa  279  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1376  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.4 
 
 
340 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0300827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.09 
 
 
339 aa  279  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.53 
 
 
359 aa  278  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.69 
 
 
344 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.36 
 
 
337 aa  278  9e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
352 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.69 
 
 
344 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
336 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.98 
 
 
345 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.98 
 
 
347 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6574  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.54 
 
 
353 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.06 
 
 
332 aa  275  6e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.83 
 
 
344 aa  275  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3240  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.69 
 
 
340 aa  275  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.25 
 
 
344 aa  275  8e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.69 
 
 
344 aa  275  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.69 
 
 
344 aa  275  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.38 
 
 
332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0114  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918447 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.41 
 
 
329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3170  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.48 
 
 
348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.55 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.99 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.24 
 
 
340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.36 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.77 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.11 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.98 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.9 
 
 
328 aa  273  3e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.43 
 
 
354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.41 
 
 
344 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
344 aa  272  7e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
344 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.55 
 
 
348 aa  271  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
344 aa  271  9e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
344 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3459  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
340 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.96 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
338 aa  269  5e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.33 
 
 
340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>