More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3567 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
341 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  95.59 
 
 
341 aa  647    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.26 
 
 
353 aa  486  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.91 
 
 
349 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.88 
 
 
356 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  68.62 
 
 
351 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0695  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.43 
 
 
353 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.45 
 
 
341 aa  455  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.85 
 
 
342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.25 
 
 
355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.17 
 
 
349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.76 
 
 
351 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.96 
 
 
344 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.96 
 
 
344 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.96 
 
 
344 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.96 
 
 
344 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.57 
 
 
341 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.96 
 
 
345 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.37 
 
 
349 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.6 
 
 
347 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  61.71 
 
 
365 aa  404  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.98 
 
 
366 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.18 
 
 
355 aa  401  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  61 
 
 
365 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0112  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.25 
 
 
341 aa  343  2e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.241314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.68 
 
 
336 aa  302  6.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
339 aa  301  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
339 aa  301  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.71 
 
 
339 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
339 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
340 aa  300  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
349 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50.44 
 
 
339 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4618  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.39 
 
 
342 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.33 
 
 
337 aa  296  3e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
349 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
351 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  49.43 
 
 
352 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
344 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.79 
 
 
340 aa  292  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.79 
 
 
340 aa  292  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.8 
 
 
339 aa  292  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.54 
 
 
341 aa  291  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.97 
 
 
341 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.98 
 
 
344 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.98 
 
 
344 aa  289  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.93 
 
 
348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9310  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.92 
 
 
355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853778  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.11 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9024  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.28 
 
 
353 aa  289  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
353 aa  288  8e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.66 
 
 
344 aa  288  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
344 aa  288  9e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
339 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.66 
 
 
344 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.4 
 
 
341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.49 
 
 
344 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.82 
 
 
344 aa  285  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0044  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.77 
 
 
340 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.64 
 
 
344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1376  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.77 
 
 
340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0300827  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0462  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.43 
 
 
357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6574  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.72 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.31 
 
 
338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.02 
 
 
338 aa  281  9e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0034  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.19 
 
 
340 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.64 
 
 
344 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.09 
 
 
342 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.69 
 
 
340 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.06 
 
 
344 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.84 
 
 
342 aa  279  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
344 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.19 
 
 
333 aa  279  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.12 
 
 
336 aa  279  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.88 
 
 
341 aa  279  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
344 aa  278  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
344 aa  278  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.86 
 
 
340 aa  278  9e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.91 
 
 
344 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.97 
 
 
340 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2775  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
340 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
345 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
357 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
335 aa  277  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.29 
 
 
348 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.15 
 
 
337 aa  276  3e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.35 
 
 
359 aa  276  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3527  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.28 
 
 
355 aa  275  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.27 
 
 
340 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.8 
 
 
354 aa  275  9e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0218  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.84 
 
 
355 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.8 
 
 
344 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>