More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0344 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  89.83 
 
 
344 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  90.99 
 
 
344 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  90.41 
 
 
344 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  90.7 
 
 
344 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  90.41 
 
 
344 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
344 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  91.57 
 
 
344 aa  650    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  82.85 
 
 
344 aa  598  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  83.14 
 
 
344 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  82.27 
 
 
344 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  81.69 
 
 
344 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  81.4 
 
 
344 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  81.69 
 
 
344 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  80.81 
 
 
344 aa  579  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  80.81 
 
 
344 aa  579  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  79.07 
 
 
357 aa  578  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  80.81 
 
 
344 aa  574  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  80.58 
 
 
345 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  81.1 
 
 
344 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  80.81 
 
 
344 aa  574  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  79.65 
 
 
344 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  79.07 
 
 
344 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  79.07 
 
 
344 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.87 
 
 
344 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  76.74 
 
 
359 aa  542  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.34 
 
 
343 aa  537  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2876  aspartate semialdehyde dehydrogenase  70.03 
 
 
341 aa  492  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2775  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.62 
 
 
340 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4618  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.68 
 
 
342 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.05 
 
 
341 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0034  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.03 
 
 
340 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0044  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.33 
 
 
340 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1376  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.03 
 
 
340 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0300827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0114  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.95 
 
 
340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918447 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3459  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.58 
 
 
340 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.68 
 
 
341 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3240  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.66 
 
 
340 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.57 
 
 
345 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.22 
 
 
342 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2718  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.91 
 
 
341 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.82 
 
 
336 aa  436  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  63.58 
 
 
339 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0944  aspartate semialdehyde dehydrogenase  59.52 
 
 
336 aa  422  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1717  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  62.46 
 
 
347 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.806069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.89 
 
 
339 aa  381  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.19 
 
 
339 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.89 
 
 
340 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
340 aa  381  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.57 
 
 
349 aa  381  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.57 
 
 
349 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.38 
 
 
341 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0954  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.87 
 
 
344 aa  374  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.59 
 
 
339 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.42 
 
 
339 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
348 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.36 
 
 
337 aa  364  1e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.28 
 
 
348 aa  364  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.73 
 
 
340 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.73 
 
 
340 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.17 
 
 
340 aa  363  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.98 
 
 
340 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  53.61 
 
 
340 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.08 
 
 
340 aa  358  6e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  52.21 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1340  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.95 
 
 
341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.665671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.98 
 
 
342 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.68 
 
 
339 aa  353  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.68 
 
 
339 aa  353  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  53.89 
 
 
339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.18 
 
 
338 aa  351  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.62 
 
 
338 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.98 
 
 
340 aa  347  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.66 
 
 
344 aa  345  5e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.82 
 
 
335 aa  345  6e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.36 
 
 
344 aa  343  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.47 
 
 
341 aa  343  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0800  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  50.6 
 
 
340 aa  343  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000180575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0350  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.17 
 
 
334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.07 
 
 
340 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  50.6 
 
 
340 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.95 
 
 
351 aa  339  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0139  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.27 
 
 
330 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.63 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.21 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.21 
 
 
340 aa  336  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.6 
 
 
347 aa  337  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3805  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.4 
 
 
339 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1066  aspartate semialdehyde dehydrogenase  53.59 
 
 
335 aa  332  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.058115  hitchhiker  0.00506315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3732  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.79 
 
 
336 aa  332  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357313  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.3 
 
 
338 aa  332  6e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1949  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
339 aa  332  7.000000000000001e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.15 
 
 
332 aa  331  9e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.705444  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04100  aspartate semialdehyde dehydrogenase  52.54 
 
 
346 aa  330  2e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.917016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.57 
 
 
340 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2308  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.55 
 
 
338 aa  328  7e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000121331  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.6 
 
 
338 aa  328  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000971394  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1484  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  49.7 
 
 
338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0171916  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.93 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1393  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.4 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.336042  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1073  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.3 
 
 
337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>