More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04750 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
351 aa  694    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  76.97 
 
 
351 aa  531  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.8 
 
 
349 aa  523  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.37 
 
 
349 aa  519  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  76.01 
 
 
355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.91 
 
 
353 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  76.66 
 
 
366 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.01 
 
 
356 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0695  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73.35 
 
 
353 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.35 
 
 
341 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.55 
 
 
342 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.64 
 
 
344 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.64 
 
 
344 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.64 
 
 
344 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.62 
 
 
341 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.01 
 
 
344 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.27 
 
 
355 aa  459  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.54 
 
 
341 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.97 
 
 
347 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.79 
 
 
345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  67.16 
 
 
341 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  67.23 
 
 
365 aa  451  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  66.86 
 
 
365 aa  438  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.4 
 
 
349 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0112  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.98 
 
 
341 aa  347  2e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.241314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.93 
 
 
347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.57 
 
 
340 aa  316  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.86 
 
 
349 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52 
 
 
342 aa  309  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.01 
 
 
349 aa  308  9e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.88 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  53.16 
 
 
339 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.44 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.3 
 
 
339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.86 
 
 
339 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
341 aa  300  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.13 
 
 
344 aa  299  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.13 
 
 
344 aa  299  5e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.56 
 
 
336 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.88 
 
 
339 aa  296  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.88 
 
 
339 aa  296  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.14 
 
 
332 aa  295  9e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.98 
 
 
341 aa  294  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.26 
 
 
339 aa  294  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.55 
 
 
348 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.98 
 
 
325 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49 
 
 
339 aa  289  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.74 
 
 
344 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.72 
 
 
352 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.43 
 
 
344 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.46 
 
 
344 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.15 
 
 
340 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.46 
 
 
344 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.4 
 
 
325 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.86 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.24 
 
 
335 aa  286  4e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
337 aa  286  4e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
341 aa  285  5.999999999999999e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.18 
 
 
344 aa  285  7e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.95 
 
 
347 aa  285  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.02 
 
 
353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9310  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.63 
 
 
355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853778  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.29 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.93 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6574  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.34 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.51 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
359 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.51 
 
 
332 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.34 
 
 
351 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46 
 
 
344 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.33 
 
 
344 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48 
 
 
354 aa  279  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.44 
 
 
342 aa  279  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.14 
 
 
338 aa  279  6e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.15 
 
 
344 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
340 aa  278  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.99 
 
 
348 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.02 
 
 
341 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3527  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.29 
 
 
355 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.29 
 
 
344 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
344 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
338 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.48 
 
 
344 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.91 
 
 
351 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.48 
 
 
344 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.22 
 
 
340 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.76 
 
 
348 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46 
 
 
357 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.22 
 
 
329 aa  275  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.43 
 
 
344 aa  275  8e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4618  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.13 
 
 
342 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0218  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
355 aa  275  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.95 
 
 
333 aa  275  9e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 
340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.29 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>