More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36370 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
349 aa  699    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  76.72 
 
 
356 aa  545  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.22 
 
 
353 aa  526  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  75.37 
 
 
351 aa  519  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0695  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73.85 
 
 
353 aa  511  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.04 
 
 
341 aa  507  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.73 
 
 
355 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73.02 
 
 
351 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73.82 
 
 
342 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.26 
 
 
341 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.11 
 
 
349 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.47 
 
 
344 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.47 
 
 
344 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.47 
 
 
344 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.22 
 
 
347 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.06 
 
 
344 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.91 
 
 
341 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.91 
 
 
341 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.35 
 
 
345 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.77 
 
 
366 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  67.43 
 
 
365 aa  455  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  65.04 
 
 
365 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  61.7 
 
 
355 aa  432  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.45 
 
 
349 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0112  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.52 
 
 
341 aa  378  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.241314  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.01 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.89 
 
 
347 aa  322  6e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.28 
 
 
339 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.28 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.29 
 
 
342 aa  305  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.28 
 
 
341 aa  305  7e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.58 
 
 
341 aa  302  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.84 
 
 
348 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
336 aa  300  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.26 
 
 
341 aa  297  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50.73 
 
 
339 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.26 
 
 
332 aa  297  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.7 
 
 
348 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 
344 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 
344 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.71 
 
 
344 aa  296  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.66 
 
 
349 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
344 aa  295  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
344 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.97 
 
 
352 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
332 aa  293  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.56 
 
 
335 aa  293  3e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.42 
 
 
344 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
344 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
344 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.44 
 
 
357 aa  293  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.84 
 
 
342 aa  292  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.27 
 
 
339 aa  292  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.51 
 
 
337 aa  292  6e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.42 
 
 
344 aa  292  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
339 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.69 
 
 
339 aa  291  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.99 
 
 
344 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
345 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.27 
 
 
351 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.55 
 
 
339 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.55 
 
 
339 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6574  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
353 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.24 
 
 
344 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.54 
 
 
333 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.56 
 
 
344 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.8 
 
 
353 aa  288  7e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.69 
 
 
343 aa  288  8e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
325 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.84 
 
 
340 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.77 
 
 
337 aa  287  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
345 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.24 
 
 
344 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.27 
 
 
340 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9310  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.86 
 
 
355 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853778  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.66 
 
 
344 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.27 
 
 
344 aa  285  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2443  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.28 
 
 
338 aa  285  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000737036  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.66 
 
 
359 aa  285  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.09 
 
 
344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.99 
 
 
344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.27 
 
 
344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.99 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.99 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.93 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.27 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.67 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.27 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.24 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0044  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.69 
 
 
340 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1615  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.42 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000415846  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2744  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.42 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000610142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.42 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000159168  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2761  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.42 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>