More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4977 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
344 aa  685    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
344 aa  685    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
344 aa  685    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  88.37 
 
 
344 aa  607  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  86.38 
 
 
347 aa  594  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  84.55 
 
 
345 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  82.89 
 
 
341 aa  549  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  81.47 
 
 
342 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  73.39 
 
 
353 aa  502  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.47 
 
 
349 aa  484  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.73 
 
 
356 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.09 
 
 
351 aa  482  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0695  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.71 
 
 
353 aa  481  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.97 
 
 
349 aa  478  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  70.64 
 
 
351 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.52 
 
 
355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.11 
 
 
341 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.83 
 
 
366 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.96 
 
 
341 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.96 
 
 
341 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  61.97 
 
 
365 aa  419  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  62.79 
 
 
365 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.35 
 
 
355 aa  409  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 
349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0112  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.86 
 
 
341 aa  343  2e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.241314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.26 
 
 
347 aa  315  8e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.71 
 
 
339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.14 
 
 
342 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.7 
 
 
335 aa  299  4e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
339 aa  298  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
339 aa  295  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
351 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.41 
 
 
341 aa  292  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.43 
 
 
344 aa  288  7e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.51 
 
 
344 aa  288  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.83 
 
 
340 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.4 
 
 
339 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.4 
 
 
339 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.24 
 
 
340 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6574  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.14 
 
 
353 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.57 
 
 
352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.14 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9024  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.14 
 
 
353 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.97 
 
 
336 aa  286  5e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
344 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.48 
 
 
338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.48 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.48 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
344 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.64 
 
 
337 aa  281  9e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.36 
 
 
341 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.77 
 
 
341 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
340 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
340 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
344 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
347 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
340 aa  280  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.83 
 
 
359 aa  279  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
344 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.19 
 
 
344 aa  279  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.97 
 
 
339 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.35 
 
 
348 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.64 
 
 
339 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.7 
 
 
328 aa  276  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3170  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.06 
 
 
348 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
357 aa  275  7e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.19 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0218  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.32 
 
 
355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.06 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0261  aspartate semialdehyde dehydrogenase  49.71 
 
 
359 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.11 
 
 
344 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.09 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.89 
 
 
340 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0462  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.87 
 
 
357 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.51 
 
 
340 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.22 
 
 
344 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.89 
 
 
340 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0034  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.16 
 
 
340 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.9 
 
 
345 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.93 
 
 
344 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.57 
 
 
353 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.6 
 
 
344 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.93 
 
 
345 aa  269  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.22 
 
 
340 aa  269  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.06 
 
 
350 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.88543 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.66 
 
 
332 aa  268  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3527  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
355 aa  268  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
349 aa  268  8e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
348 aa  268  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.54 
 
 
336 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0044  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
340 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1376  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
340 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0300827  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1340  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.95 
 
 
341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.665671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.09 
 
 
348 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>