More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3527 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3527  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
355 aa  707    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9310  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.63 
 
 
355 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0853778  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.78 
 
 
351 aa  534  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  75.64 
 
 
352 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.64 
 
 
353 aa  532  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0218  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.07 
 
 
355 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9024  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.8 
 
 
353 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0462  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.93 
 
 
357 aa  506  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6574  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.88 
 
 
353 aa  501  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0261  aspartate semialdehyde dehydrogenase  70.17 
 
 
359 aa  478  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0494  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 
352 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0266  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.23 
 
 
353 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0227  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  62.82 
 
 
353 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.14 
 
 
336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
337 aa  301  9e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19630  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
365 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04750  aspartate semialdehyde dehydrogenase  49.29 
 
 
351 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148631  normal  0.366331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.43 
 
 
355 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1448  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.86 
 
 
345 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.28 
 
 
341 aa  289  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49 
 
 
349 aa  288  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49 
 
 
341 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.66 
 
 
348 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.66 
 
 
348 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.66 
 
 
349 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.66 
 
 
349 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.66 
 
 
348 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.66 
 
 
348 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.92 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.45 
 
 
348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000194693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00002128  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5256  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
344 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3118  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.17 
 
 
351 aa  281  9e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58644  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4888  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
344 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0210913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4977  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
344 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0420  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
349 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
340 aa  281  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.15882  hitchhiker  0.00000411486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5503  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.3 
 
 
344 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3981  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
341 aa  279  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.57 
 
 
348 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
342 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.411307  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.78 
 
 
350 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.88543 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.01 
 
 
354 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4072  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.06 
 
 
349 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.88 
 
 
347 aa  275  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3170  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
348 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.07 
 
 
348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.9 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0322  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.62 
 
 
335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13740  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.02 
 
 
345 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.363884  normal  0.189001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1305  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
347 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00711  aspartate semialdehyde dehydrogenase  44.13 
 
 
343 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1776  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.5 
 
 
334 aa  272  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.28 
 
 
355 aa  270  4e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2919  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.74 
 
 
340 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0618  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.02 
 
 
352 aa  267  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.43 
 
 
356 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.79 
 
 
347 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4362  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
351 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  41.03 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28310  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.37 
 
 
365 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.69 
 
 
333 aa  266  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
342 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
338 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.68 
 
 
348 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1042  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
343 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.54 
 
 
339 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.11 
 
 
338 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1641  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
332 aa  263  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000438606  normal  0.466828 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.97 
 
 
341 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
340 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2465  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.28 
 
 
347 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.844771  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1167  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.86 
 
 
343 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0765  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
343 aa  261  8.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00127422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1949  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.6 
 
 
339 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
338 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
339 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
339 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2268  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.44 
 
 
347 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0527  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
338 aa  261  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2436  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.44 
 
 
347 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
345 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.36 
 
 
348 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2452  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.72 
 
 
347 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1252  aspartate semialdehyde dehydrogenase  40.29 
 
 
345 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.97 
 
 
339 aa  258  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2228  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.44 
 
 
347 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0790084  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21221  aspartate semialdehyde dehydrogenase  40.86 
 
 
345 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2530  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.15 
 
 
347 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00134439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.97 
 
 
339 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.15 
 
 
347 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2173  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.99 
 
 
338 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00782862  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
332 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.705444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  41.69 
 
 
339 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1748  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.81 
 
 
360 aa  255  7e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>